PCR中如何计算引物的Tm值??
直接计算 ™开发者_运维知识库=2(A+T)+4(G+C)
或是用软件来计算 公式计算的肯定没问题的
_WeCh****667517 开发者_开发知识库 2021-08-12 04:12
常用的公式是Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T),基本还是很准确的,另外你在订购引物的时候,会有引物合成单的,上面也会标明引物的Tm的,上面的更为准确的。
qkoufu530开发者_如何学运维8 2021-08-12 04:13
使用最邻近法并结合 SantaLucia 1998 热力学参数表和 Schildkraut 1965盐浓度校正公式所预测的Tm值最接近实测数据。最邻近法是最准确的Tm值预测方法,而且当PCR引物的GC含量越接近于50%时,其预测准确率越高。张艳春_2011_DNA解链温度_Tm_不同预测方法的比较.pdf2014-10-24 3 0分享 新浪微博 qq空间 微信
Tm值就是DNA熔解温度,指把DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。不同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G-C含量越高,Tm值越高,成正比关系。引物设计软件都可以给出Tm,引物长度,碱基组成,引物使用缓冲的离子强度有关。
长度为25mer以下的引物,Tm计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)
对于更长的寡聚核苷酸,Tm计算公式为:
Tm = 81.5 + 16.6 x Log10[Na+] + 0.41 (%GC) – 600/size
精彩评论