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分子生物信息数据库种类繁多,有具体的分类吗??

我的口袋饼 2021-07-14 19:37


补充说下4大分类相关的一次数据库和二次数据库。
分子生物信息学的基本数据资源,通常称为基本数据库,初始数据库,也称一次数据库。根据生命科学不同研究领域的实际需要,对基因组图谱、核酸和蛋白质序列、蛋白质结构以及文献等数据进行分析、整理、归纳、注释,构建具有特殊生物学意义和专门用途的二次数据库,是数据库开发的有效途径。近年来,世界各国的生物学家和计算机科学家合作,已经开发了几百个二次数据库和复合数据库,也称专门数据库、专业数据库、专用数据库。

一般说来,一次数据库的数据库量大,更新速度快,用户面广,通常需要高性能的计算机硬件、大容量的磁盘空间和专门的数据库管理系统支撑。

二次数据库种类繁多,以核酸数据库为基础构建的二次数据库有基因调控转录因子数据库TransFac,真核生物启动子数据库EPD,克隆载体数据库Vector,密码子使用表数据库CUTG等。以蛋白质序列数据库为基础构建的二次数据库有蛋白质功能位点数据库Prosite,蛋白质功能位点序列片段数据库开发者_JAVA百科Prints,同源蛋白家族数据库Pfam,同源蛋白结构域数据库Blocks。


你神经病a 开发者_StackOverflow2021-07-14 19:51


分子生物信息数据库种类确实很多,归纳起来大致可以分为4个大类,即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构序列数据库、生物大分子(主要是蛋白质)三维空间结构数据库及以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库。


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