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目前主要的DNA数据库有哪些??

赵杰 2021-07-25 05:51


国际上比较重要的核酸(含蛋白质)一级数据库有美国的GenBank、欧洲的EMBL和日本的DDBJ。三个数据库信息共享,每日交换,故资料是一样的,唯格式有所不同。中国的DNA系统是最近10年间才发展起来的,DNA数据库系统,有数据量大,增长量快,比对复杂等特点。
GenBank是美国国家生物技术信息中心建立的DNA序列数据库,从公共资源中获取序列数据,主要是科研人员直接提供或来源于大规模基因组测开发者_运维技巧序计划。为保证数据尽可能的完全,GenBank与EMBL、DDBJ建立了相互交换数据的合作关系。
EMBL是欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)创建的一个核酸序列数据库。EMBL的数据来源主要有两部分,一部分由科研人员或某些基因组测序机构通过计算机网络直接提交,另一部分则来自科技文献或专利。
DDBJ是DNA Data Bank of Japan的简称,始建于1986年,由日本国立遗传学研究院负责数据库的建设,维护及数据的传播,并与EMBL和GenBank合作;可以从世界各地通过网络把序列直接提交该数据库。DDBJ网页上也提供了包括FastA和BLAST在内的数据库查询工具。
此外,较大型的数据库还有日本的dbEST以及美国的GSDB,dbEST有自己的格式和识别代码系统,序列信息以及dbEST的注释摘要,也按DNA的分类分成了若干子数据库。GSDB由位于新墨西哥州Santa Fe的国家基因组资源中心创建。GSDB收集、管理并且发送完整的DNA序列及其相关信息,以满足主要基因组测序机构的需要。
除了涵盖从完整基因组到单个基因各个方面的综合DNA序列数据库,还有些更有针对性的基因组资源,或称专用数据库。它们主要的目的是为某一特定的物种提供一个更为完整的数据库资源,如模式生酵母、 线虫、果蝇、拟南芥、幽门螺杆菌等。


黄江AO车行 2021-07-25 05:58


补充楼上,欧洲的EMBL 数据库,是欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)创建的一个核酸序列数据库。来源主要开发者_Python百科有两部分,一部分由科研人员或某些基因组测序机构通过计算机网络直接提交,另一部分则来自科技文献或专利(Stoesser等, 1998)。EMBL与DDBJ、GenBank建有合作关系,他们分别在全世界范围内收集核酸序列信息,每天都将新发现或更新过的数据相互交换。


草莓荔枝美乃滋 2021-07-25 06:04

开发者_JS百科
你好,目前,主要的DNA数据库有3个。它们分别是美国的GenBank、欧洲的EMBL和日本的DDBJ。
三个数据库信息共享,每日交换。


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