体外DNA结合谱的现状??
鉴于体开发者_JS百科内DNA结合谱存在的缺陷,近年来转录因子体外DNA结合谱的研究得到了越来越多的重视。由于脱离了特定实验材料(如细胞、组织)的限制,体外结合谱研究的实验过程处于完全人工控制的环境中,避免了体内一些复杂的环境因素如其他因子的干扰等,从而能够完整地显示出转录因子蛋白与DNA结合的各种重要信息,如特异性、亲和性、经典模体、非经典模体、半位点、间隔序列及加和效应等。同时,通过使用随机组合DNA序列,体外结合谱研究能够发现一个转录因子结合的所有DNA序列以及对各序列的相对亲和性,因此能绘制出信息完整的高分辨率DNA结合谱,这种结合谱对鉴定功能靶点及靶基因非常重要。目前,转录因子体外DNA结合谱绘制主要依靠双链DNA微阵列芯片技术、与指数富集配体系统进化技术相结合的高通量DNA测序技术,以及最新出现的高通量测序-荧光配体互作图谱分析技术。
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