有谁能说明下什么是Bind-n-Seq技术么？？

花洱一詹妮芙 开发者_开发技巧 2021-08-03 21:09

2009年,美国加州大学基因组中心的Zykovich等首次使用SELEX技术联合下游多重平行测序技术实现了对DNA结合蛋白Zif268和Aart结合位点的同时鉴定,此技术被称之为Bind-n-Seq。该研究首次表明将经典的SELEX技术与高通量DNA测序技术相结合,可用于研究转录因子高分辨率精细DNA结合模体。为了充分利用高通量DNA测序技术巨大的测序通量,该技术对不同转录因子蛋白筛选的DNA样品使用了碱基条形码技术。在测序之前将这些样品混合,作为一个测序样品进行测序,这样可极大地降低实验成本。传统SELEX-克隆测序实验仅能获得几十条到数百条DNA序列信息,SELEX-SGAE技术可获得数千条DNA序列信息,而Bind-n-Seq技术首次将SELEX筛选DNA的序列解码能力提高到数百万条,在转录因子体外结合研究中真正实现了结合谱的绘制。

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