PacBio RS有哪些应用呢？？

鸡鸡哥 2021-08-17 02:32

PacBio RS有以下四点应用：
1.甲基化分析
美国芝加哥大学利用第三代单分子SMRT测序技术和5-hmC的选择性化学标记方法来高通量检测5-hmC。通过聚合酶动力学带来的宝贵信息，研究人员可直接检测DNA甲基化，包括N6-甲基腺嘌呤、5-mC和5-hmC。
2.病原微生物鉴定
由于PacBio从样本制备到获得序列信息所需时间非常短（开发者_JAVA百科<1天），在具有时效性的病原微生物鉴定中（例如生物反恐、流行病爆发监控等）也非常有优势。一个国际小组利用Pacific Biosciences的单分子测序技术，深入研究了欧洲大肠杆菌菌株的致病性和进化起源，该研究成果发表在《新英格兰医学杂志》上。
3.高GC含量区域测序
美国加州大学戴维斯分校医学院利用单分子实时测序技术，对脆性X染色体综合征的关键基因FMR1中的CGG三核苷酸重复区域进行了测序。
4.稀有突变检测
PacBio无需扩增、对每一个单分子模板都进行评估，对于混合群体中低至 1/100的稀有突变都可以检出。
http://www.ebiotrade.com/newsf ... 1.htm
http://www.ebiotrade.com/newsf ... 3.htm
http://www.ebiotrade.com/newsf ... 1.htm
http://www.ebiotrade.com/emgzf ... 5.pdf

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ty_127385356 开发者_C百科 2021-08-17 02:44

PacBio的读长可以达到10kb以上，因此对于较小的微生物基因组，可以直接测通了，都不用拼接；
另外如果测转录组的话，可以获得全长转录本测序，拼接上肯定要比二代测序更准确和方便。

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