RNA测序到底可不可靠呢？？
ty_嘉嘉40
2021-09-11 15:02
开发者_开发技巧
只要技术成熟，当然靠谱！首先提取生物样品的全部转录的RNA，然后反转录为c-DNA后进行的二代高通量测序，在此基础上进行片段的重叠组装，从而可得到一个个的转录本。进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解。进一步说，若和下一阶段的生物样品的RNA-Seq转录组进行比较，则可以得到全部的（在转录层面）基因表达的上调及下调--这就形成了表达谱。
ty_f461 2021-09-11 15:08
相对来说，是可靠的。由美国FDA牵头的测序质量控制(SEQC)项目对RNA测序的准确性、可重现性和信息含量进行了综合性评估，究团队使用RNA参照样本，在全球多个实验室的Illumina HiSeq、Life Technologies SOLiD、Roche 454平台上进行了检测。结果发现，所有测序深度都会出现未注释的外显子-外显子连接区域，其中80%以上都得到了qPCR的验证。用RNA测序检测相对表达可以得到准确且可重复的结果，但RNA测序和芯片都不能提供精确的绝对测量，而且研究用到的平台都存在基因特异性的偏好，包开发者_运维技巧括qPCR。
只要技术成熟，当然靠谱！首先提取生物样品的全部转录的RNA，然后反转录为c-DNA后进行的二代高通量测序，在此基础上进行片段的重叠组装，从而可得到一个个的转录本。进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解。进一步说，若和下一阶段的生物样品的RNA-Seq转录组进行比较，则可以得到全部的（在转录层面）基因表达的上调及下调--这就形成了表达谱。
ty_f461 2021-09-11 15:08
相对来说，是可靠的。由美国FDA牵头的测序质量控制(SEQC)项目对RNA测序的准确性、可重现性和信息含量进行了综合性评估，究团队使用RNA参照样本，在全球多个实验室的Illumina HiSeq、Life Technologies SOLiD、Roche 454平台上进行了检测。结果发现，所有测序深度都会出现未注释的外显子-外显子连接区域，其中80%以上都得到了qPCR的验证。用RNA测序检测相对表达可以得到准确且可重复的结果，但RNA测序和芯片都不能提供精确的绝对测量，而且研究用到的平台都存在基因特异性的偏好，包开发者_运维技巧括qPCR。
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