单细胞基因组测序的意义？？
杏儿飘香
2021-09-20 08:39
与传统的全基因组测序相比，单细胞测序不仅测量基因表达水平更加精确，而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA，其优势是全方位和多层次的。
单细胞全基因组测序技术是在单开发者_C百科细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增，获得高覆盖率的完整的基因组之后通过外显子捕获进而高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。
小汉梨 2021-09-20 08:44
首先，单细胞测序和基因组测序是两个概念，合在一起的话这个范围就会缩小的非常小，不利于后续展开讨论。
那我们分开讨论一下好了。
首先基因组测序：这个通常情况下指将样本的全基因组测了。一般用在检测snp InDel等单核苷酸或小片段的变异，以及染色体结构变异和拷贝数变异等。也就是一般所说的看我们的DNA和正常健康人有什么区别这种，哪些片段可能致病等等。
但是目前的生物学并不是说获得了全基因组DNA就可以解释一切了，事实上二代测序这个技术目前在科研界也算是很前沿。而用途也不仅仅就是测一个全基因组DNA。
譬如有的科研工作者关注表观遗传，就是由DNA甲基化或者组蛋白甲基化引起的变化，有的则关注转录水平的变化，还有的关注长链非编码RNA--目前比较时尚的一个研究热点，还有关注miRNA的，总之各种各样。
这时候他们就会把同一个组织，譬如一小坨肉，提取它的DNA研究基因组变化，提取它的RNA研究转录组变化，搞个抗体处理下做个免疫共沉淀研究转录因子的变化，等等。也就是说二代测序的应用场景有很多，不局限于全基因组测序。
第二单细胞测序：这个主要是将单个细胞分离出来，然后抽提其DNA，或RNA等进行测序。也就是说只要拿到单细开发者_如何转开发胞了，你提取到什么就可以测什么，不局限于全基因组测序。
通常来说，像做疾病病人样本的一般并不需要单细胞测序，因为病灶组织可能比较大，很多病灶均一性也还可以，对照也通常是外周血等，做单细胞费钱而且意义并不是非常大。就算是组织特异性很强很小的组织，也可以用激光显微切割来拿到组织而不必非用单细胞测序不刻。
那么什么时候会非要用单细胞才能解决问题呢？我说几个常见的场景
研究胚胎发育时期的，或者干细胞的。因为胚胎发育是从少数几个细胞发展到多数细胞的过程，其中最早期时候几个干细胞如何进行分化，或者说外胚层中胚层如何进一步分化出神经组织这块，材料及其难取，并且确确实实真就是那么几个细胞起作用然后导致组织分化。这时候科学家们就会用单细胞测序的手段，搞一个到若干个细胞出来，然后建库测序，这时候测全基因组的意义也不大。因为组织的DNA都是一样的，完全可以等这个胚胎长大点再进行测序。所以一般单细胞主要测转录组、甲基化等（我不知道单细胞是否可以测甲基化，只是因为2010年那会儿开始甲基化非常火，譬如5hmc等发了很多cns）。譬如2013年单细胞测序就发了很多测转录组的文章，并且证实胚胎干细胞发育的异质性存在（其实这结论不说我也知道）等等有趣的发现。
非常早期的产前诊断，这就可以上题主的单细胞全基因组测序了。譬如我曾经跟耶鲁的潘星华教授聊过（这家伙是单细胞测序的高手，建了一整套单细胞测序的体系。据说还开了个公司还卖了个试剂盒给QIAGEN）。他说国外有尝试分离孕妇外周血中混杂的胎儿有核红细胞，然后，想测什么测什么。这里最难的在于如何分离胎儿有核红细胞。
现在有技术可以把 试管婴儿 8细胞时期，取一个细胞出来，做二代测序，来看这个小孩可能有什么遗传病。当然仅仅看21三体等染色体变异病。那么个人感觉（不负责任的猜测啊）我们就可以拿这个细胞做全基因组测序，来看这个小孩可能有什么遗传病。比仅仅看三体这种精确很多呢。
所以题主的问题--单细胞基因组测序的意义--应该就是我最后说的应用场景的第二点和第三点咯。
ty_夏水流萤4 2021-09-20 08:45 开发者_StackOverflow
高通量测序技术飞快向前发展，测序价格更是由第一个人类基因组测序成本的30亿美元下降到5000-10,000美元，然而在遗传信息用于医疗诊断和疾病治疗的过程中，科研人员仍面临一个问题，那就是如何通过一个细胞样本测通基因组序列。之前的测序都是忽略细胞间的差异，而对同一组织的大量细胞的测序往往会生成多重数据，这不利于追踪细胞病变过程和细胞间状态差异。面对这一科学困境，以单细胞为样本的测序技术可对细胞内30亿对碱基测序从而拓展了这一领域内的研究。
单细胞全基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增，获得高覆盖率的完整的基因组后进行高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。
ggg0301 2021-09-20 08:54 开发者_运维知识库
单细胞基因组测序技术是一种让人难以置信的新技术，这种技术的应用潜力无法估量，我们可以凭借这种技术轻而易举的攻克肿瘤难题。
与传统的全基因组测序相比，单细胞测序不仅测量基因表达水平更加精确，而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA，其优势是全方位和多层次的。
单细胞全基因组测序技术是在单开发者_C百科细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增，获得高覆盖率的完整的基因组之后通过外显子捕获进而高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。
小汉梨 2021-09-20 08:44
首先，单细胞测序和基因组测序是两个概念，合在一起的话这个范围就会缩小的非常小，不利于后续展开讨论。
那我们分开讨论一下好了。
首先基因组测序：这个通常情况下指将样本的全基因组测了。一般用在检测snp InDel等单核苷酸或小片段的变异，以及染色体结构变异和拷贝数变异等。也就是一般所说的看我们的DNA和正常健康人有什么区别这种，哪些片段可能致病等等。
但是目前的生物学并不是说获得了全基因组DNA就可以解释一切了，事实上二代测序这个技术目前在科研界也算是很前沿。而用途也不仅仅就是测一个全基因组DNA。
譬如有的科研工作者关注表观遗传，就是由DNA甲基化或者组蛋白甲基化引起的变化，有的则关注转录水平的变化，还有的关注长链非编码RNA--目前比较时尚的一个研究热点，还有关注miRNA的，总之各种各样。
这时候他们就会把同一个组织，譬如一小坨肉，提取它的DNA研究基因组变化，提取它的RNA研究转录组变化，搞个抗体处理下做个免疫共沉淀研究转录因子的变化，等等。也就是说二代测序的应用场景有很多，不局限于全基因组测序。
第二单细胞测序：这个主要是将单个细胞分离出来，然后抽提其DNA，或RNA等进行测序。也就是说只要拿到单细开发者_如何转开发胞了，你提取到什么就可以测什么，不局限于全基因组测序。
通常来说，像做疾病病人样本的一般并不需要单细胞测序，因为病灶组织可能比较大，很多病灶均一性也还可以，对照也通常是外周血等，做单细胞费钱而且意义并不是非常大。就算是组织特异性很强很小的组织，也可以用激光显微切割来拿到组织而不必非用单细胞测序不刻。
那么什么时候会非要用单细胞才能解决问题呢？我说几个常见的场景
研究胚胎发育时期的，或者干细胞的。因为胚胎发育是从少数几个细胞发展到多数细胞的过程，其中最早期时候几个干细胞如何进行分化，或者说外胚层中胚层如何进一步分化出神经组织这块，材料及其难取，并且确确实实真就是那么几个细胞起作用然后导致组织分化。这时候科学家们就会用单细胞测序的手段，搞一个到若干个细胞出来，然后建库测序，这时候测全基因组的意义也不大。因为组织的DNA都是一样的，完全可以等这个胚胎长大点再进行测序。所以一般单细胞主要测转录组、甲基化等（我不知道单细胞是否可以测甲基化，只是因为2010年那会儿开始甲基化非常火，譬如5hmc等发了很多cns）。譬如2013年单细胞测序就发了很多测转录组的文章，并且证实胚胎干细胞发育的异质性存在（其实这结论不说我也知道）等等有趣的发现。
非常早期的产前诊断，这就可以上题主的单细胞全基因组测序了。譬如我曾经跟耶鲁的潘星华教授聊过（这家伙是单细胞测序的高手，建了一整套单细胞测序的体系。据说还开了个公司还卖了个试剂盒给QIAGEN）。他说国外有尝试分离孕妇外周血中混杂的胎儿有核红细胞，然后，想测什么测什么。这里最难的在于如何分离胎儿有核红细胞。
现在有技术可以把 试管婴儿 8细胞时期，取一个细胞出来，做二代测序，来看这个小孩可能有什么遗传病。当然仅仅看21三体等染色体变异病。那么个人感觉（不负责任的猜测啊）我们就可以拿这个细胞做全基因组测序，来看这个小孩可能有什么遗传病。比仅仅看三体这种精确很多呢。
所以题主的问题--单细胞基因组测序的意义--应该就是我最后说的应用场景的第二点和第三点咯。
ty_夏水流萤4 2021-09-20 08:45 开发者_StackOverflow
高通量测序技术飞快向前发展，测序价格更是由第一个人类基因组测序成本的30亿美元下降到5000-10,000美元，然而在遗传信息用于医疗诊断和疾病治疗的过程中，科研人员仍面临一个问题，那就是如何通过一个细胞样本测通基因组序列。之前的测序都是忽略细胞间的差异，而对同一组织的大量细胞的测序往往会生成多重数据，这不利于追踪细胞病变过程和细胞间状态差异。面对这一科学困境，以单细胞为样本的测序技术可对细胞内30亿对碱基测序从而拓展了这一领域内的研究。
单细胞全基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增，获得高覆盖率的完整的基因组后进行高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。
ggg0301 2021-09-20 08:54 开发者_运维知识库
单细胞基因组测序技术是一种让人难以置信的新技术，这种技术的应用潜力无法估量，我们可以凭借这种技术轻而易举的攻克肿瘤难题。
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