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如何通俗地解释“人类基因敲除计划(Human Knockout Project)”的意义??

u_111077105 2021-10-12 14:01

开发者_如何转开发
只知道什么是基因敲除。
将细胞基因组中某基因去除或使基因失去活性的技术。去除原核生物细胞、真核生物的生殖细胞、体细胞或干细胞基因组中的基因等。广义的基因敲除包括某个或某些基因的完全敲除、部分敲除、基因调控序列的敲除以及成段基因组序列的敲除。常用同源重组的方法。敲除的基因用以观察生物或细胞的表型变化,是研究基因功能的重要手段。
人类基因敲除计划我完全没有听过。


360U1329546589 2021-10-12 14:05


有些人体内可能就缺少了某些对于人体健康非常重要的基因,但是他们都非常健康,没什么毛病,他们是健康的基因敲除个体。这些基因敲除人可以为我们提供很多生物医药方面的贡献。目前,科学家MacArthur团队已开展寻找这些健康的敲除基因人的计划,即“人类基因敲除计划(Human Knockout Project)”

MacArthur团队对健康“基因敲除人”的寻找工作源于两个患病的小男孩。研究发现,这两个小男孩与他们的父母,体内都携带了一对变异的ACTN3等位基因,他们的肌肉里没有找到ACTN3蛋白,可是这对父母却没有问题,非常健康。最终找到了让这对兄弟患病的基因,不过是另外一个基因。

这对患儿的父母给科学家们提供了一个非常好的例子——我们可以在日常生活中去寻找那些天然存在的“基因敲除人”,看看他们和正常基因携带者都有哪些区别。这些“基因敲除人”可以为我们提供很多生物医药方面的贡献。科研人员们一直在寻找致病基因,因为这些基因可以当作药物作用的靶点,在治疗疾病时即可以抑制它们的活性,也可以想办法恢复、代偿它们的活性。随着基因敲除人的出现,我们又多了另外一条思路,我们还可以寻找那些缺失之后对身体健康有益的基因,这样就可以抑制正常人体内与此对应的、“正常的”基因,改善人体的健康状况。

比如从事艾滋病研究的科研人员就发现,有些人体内就缺乏一种基因(这种基因编码一种细胞表面蛋白),他们就对HIV病毒具有先天的抵抗力,不会染上艾滋病。这种表面蛋白现在已经成为了一个非常热门的药物作用靶点,为我们开辟了另外一条抗HIV病毒的新途径。

PCSK9基因是“基因敲除人”的一种模范基因。

最近开展的一系列研究证明,PCSK9基因编码的一种酶可能具有调控LDL脂蛋白的作用,而我们都知道LDL脂蛋白是心脏病患病的高危风险因素。科学家Hobbs和Cohen找到了一位34岁的妇女,这名妇女就是PCSK9基因完全缺失者,她体内就不存在PCSK9蛋白,所以这名妇女的LDL水平也是被调查人群中最低的,而且她非常健康。而且在临床实验中也证实了这种想法,PCSK9蛋白抑制剂早期临床实验发现,这类药物的确能够降低血胆固醇水平,而且降低比例高达57%。

PCSK9基因也因此成为了一面旗帜,证明了我们人类缺失了某些基因非但不会给健康带来损害,反而会给身体带来某些益处,是一种非常好的药物作用靶点。这种健康基因敲除人的出现表明,很多基因并不一定是必不可少的,抑制这些基因的功能也不会带来有害的副作用。

不过在此之前,没有人知道在人类基因组当中有多少个类似PCSK9这样的基因。这也是MacArthur启动他的调查计划的原因。MacArthur团队对185名参加了人类遗传学变异研究工作的志愿者的基因组进行了审查,确定了一些功能缺失型突变。他们最终发现,每个人平均都携带了100个左右的功能缺失基因,其中有20个左右属于纯和型缺失基因,即完全的基因敲除者。

MacArthur他们这些寻找健康敲除基因的人目前正计划扩大搜寻范围。他们将对更多健康人的DNA序列进行发掘,找到更多具有潜在价值的基因,并且要看看缺失了这部分基因是否会给人带来额外的益处,比如患上急性心梗或者高血压病的几率更低,抑或也能发现这些人的“独特”之处等等。

开展这项工作最有效的手段不是大海捞针一般的在人群中进行寻找,因为这种缺失基因的正常人都是非常罕见的。所以更有效的办法应该是在特定的人群中进行搜寻,比如芬兰人(Finns)这种从历史角度来说相对独立、隔离的人群。早在4000多年前,有一小部分人来到芬兰并定居下来。由于芬兰人的祖先数量比较少,所以基因库叶相对比较小,这样功能缺失基因的比例就被无形中给放大了。科学家Palotie团队对3000名芬兰人的外显子(即编码基因的DNA序列)序列进行了分析,结果发现,这些芬兰人基因缺失的比例要比对照组的北欧人群高一倍。

Palotie认为,这从概念上证明了,对一个相对封闭的群体进行搜寻更容易找到这种良性的、对身体健康具有保护作用的可缺失基因。

并非所有人都认为只应该在健康人群中寻找可敲除基因。Lifton就认为也可以从非正常人群(这些人可能因为缺失了某个基因而致病,或者导致了某种明显的异常)中发现更多的药物作用靶点。Lifton以一种基因为例,这是一种与神经递质(neurotransmittor)合成有关的基因,如果该基因发生纯和型功能缺失突变,携带者就会表现出嗜睡(narcolepsy)的症状。通过对该基因的研究开发出了一种新型的安眠药,目前该药正在等待药物监管部门的审批。

MacArthur也接受了这样的意见,他决定在他的人类基因敲除数据库中同时收录健康人和患者的数据,而且要尽可能收集到最详尽的临床资料。除了开发者_运维问答收集已经发表的,因为功能缺失基因致病的相关信息之外,MacArthur的团队还在新建一个最新的缺失基因列表,他们为此对博大研究院和其他研究中心研究过的8万名患者和健康人的测序数据进行了梳理。


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