人重测序的SNP和SV变异位点对药物靶点发现有何作用??
重测序能够检测全基因组的罕见变异,可以获得大量的单核苷酸多态性(SNP)信息、序列的插入缺失位点信息,还可以检测到多种结构变异(SV)和拷贝数变化(CNV)。
利用测序结果,未来我们着重于根据个体SNP差异进行个性化医疗,即根据每个人不同的遗传背景选择最适合个人的用药及治疗方案。同时,测序结果在疾病风险预测(第三方医疗检测),肿瘤治疗(早诊,生物标志物发现),新药研发(药厂用于发现新的药物靶标)中有广泛的应用。
东方逍遥职 2021-11-12 06:34 开发者_如何转开发
楼上说得不错,做点补充:
在全基因组一致性序列的基础上,从中提取全基因组中所有的潜在多态性位点,再根据质量值、深度、重复性等因素做进一步的过滤筛选,最终得到高可信度的SNP数据集。根据已有的基因集对检测到得变异进行注释。
利用测序个体序列与参考基因组序列进行比对,检测全基因组水平的结构变异(SV),目前能够检测到得结构变异类型主要有缺失、插入、复制、倒位、易位等,并根据已有的基因集对检测到得变异进行注释。
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