基因组数据平台现在现状怎样？？

李坚 2021-04-10 09:30

可以说现在是黄金发展期啊。今年3月基因组学领域的科研工作者们迎来了一件大喜事：美国国立卫生研究院NIH取消了不准将其dbGap数据库中的基因组信息上传到云端的规定。这一规定设立于2007年，它的取消无疑为科研工作者存储和分析基因组信息提供了便利。
云计算服务通过按需付费模式提供海量的存储和计算资源。使用云服务要通过互联网，而且计算资源是共享的，这就引起了很多科研资助机构的疑虑，他们担心云计算的使用会泄露样本提供者的隐私。NIH取消不准上传到云端的规定是因为基因组学研究中正面临着现实问题：如何获取数据库中的大量数据。这已经阻碍了科研人员的工作，尤其是当研究工作涉及到现有的数据信息时。
为了充分利用云计算技术所提供的便利，我们敦促NIH和其他科研资助机构在常用的云平台中免费提供基因组数据。这样全球数以千计的科研人员就不用浪费自己的时间和金钱将数据转移开发者_运维技巧到自己熟悉的云平台，只要从这个统一的数据平台进行存储和分析就可以了。
随着基因组排序技术的提高，大型基因数据库中的信息都是以PB计的（1PB=10^15字节）。比如国际癌症基因组联盟ICGC的数据库中不到五年时间就积累了从17个国家收集而来的超过2PB数据，这相当于50万张DVD的容量。

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