核酸单位中mers, nt, bp有什么区别?
都是指一个碱基字符。
mers的概念经常用于序列组装上,是指把一条长的序列(DNA、RNA、reads或别的什么),逐碱基切割成短片段,这个短片段长度是多少就称为几mer。例如,对100bp的reads,按40mer(即40bp)逐碱基切割,一共可以得到100-40+1=51个40mer的片段。
我们知道,核苷酸由一个含氮碱基,一个五碳糖和一个磷酸基团组成;nt,即核苷酸(Nucleotide),是从核苷酸的角度描述核酸的一个单位长度;bp,即碱基对(base pair),是从含氮碱基的角度描述一个单位长度。
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