如何将二代测序技术应用到临床医学领域?以及存在搭建二代平台遇到的困难??
第二代测序技术-大规模平行测序
大规模平行测序平台(massively parallel DNA sequencing platform)的出现不仅令DNA测序费用降到了以前的百分之一,还让基因组测序这项以前专属于大型测序中心的“特权”能够被众多研究人员分享。新一代DNA测序技术有助于人们以更低廉的价格,更全面、更深入地分析基因组、转录组及蛋白质之间交互作用组的各项数据。
市面上出现了很多新一代测序仪产品,例如美国Roche Applied Science公司开发者_C百科的454基因组测序仪、美国Illumina公司和英国Solexa technology公司合作开发的Illumina测序仪、美国Applied Biosystems公司的SOLiD测序仪。Illumina/Solexa Genome Analyzer测序的基本原理是边合成边测序。
并且包 括 全 基 因 组 重 测 序 (whole-genomesequencing,WGS)、全外显子组测序 (whole-exomesequencing,WES) 和目标区域测序 (Targeted regionssequencing,TRS),它们同属于新一代测序技术。总体而言,NGS 技术具有通量大、时间短、精确度高和信息量丰富等优点,使得遗传学者可以在短时间内对感兴趣的基因进行精确定位。但这些不同的测序技术在测序范围、数据分析量以及测序费用和时间等方面又有很大差别,如果选择适合的方法,对于临床诊断和科学研究将起到事半功倍的作用。
因此我相信选择合适的测序方法和适合的测序仪器应该是一个很大的问题吧。
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