RNA-Seq面临着怎样的问题？？

张蓉 开发者_StackOverflow 2021-06-06 16:27

RNA-Seq技术也面临着一系列新问题：其一是庞大的数据量所带来的信息学难题,比如如何最好地诠释和比对鉴定多个类似的同源基因,如何确定最佳测序量,获得高质量的转录图谱等;其二是如何针对更复杂的转录组来识别和追踪所有基因中罕见RNA亚型的表达变化。有可能提前实现这一目标的将是使用配对末端测序和单分子测序等更新的测序技术,以及使用更长的读段来增加测序深度和覆盖度;其三,目前的高通量测序技术大都需要较多的样品起始量,这使得来源极为有限的生物样品分析受到限制,因此如何对单细胞或少量细胞进行转录组测序是一个亟待解决的问题。

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