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迄今为止,最大基因组测序是什么树种??

ty_手可摘星辰 2021-06-23 17:43


是火炬松。火炬松(拉丁学名:Pinus taeda L.),乔木,在原产地高达30米;树皮鳞片状开裂,近黑色、暗灰褐色或淡褐色;枝条每年生长数轮;小枝黄褐色或淡红褐色;冬芽褐色,矩圆状卵圆形或短圆柱形,顶端尖,无树脂。针叶3针一束,稀2针一束,长12-25厘米,径约1.5毫米,硬直,蓝绿色。原产北美东南部。我国庐山、南京、马鞍山、富阳、安吉、闽侯、武汉、长沙、广州、桂林、南宁、柳州、梧州等地引种栽培。开发者_如何学Go
目前,火炬松正在书写一段与众不同的历史:火炬松的基因组有221.8亿个碱基对——约为人类基因组的7倍多,是目前已完成测序的最大基因组。
火炬松原产于美国东南部,是美国南方松中重要的速生针叶用材树种。在基因测序工作伊始,火炬松就被确定为研究对象。然而,火炬松基因组的庞大规模给传统的全基因组“鸟枪法”测序(只能对短的基因组片段进行测序)出了一道难题。
新研究中,研究人员改进了原有的“鸟枪法”——利用基因克隆方法对多带带的DNA片段进行预处理,因而能够更容易地拼装出一个完整的基因组。该团队发现,82%的火炬松基因组由重复的基因片段组成——而人类基因组中重复的基因片段只占25%。研究人员将该结果发表于近日的《基因组生物学》和《遗传学》杂志上。研究人员还确定了能解释火炬松重要特性(例如抗病性、木材形成、应激反应)的基因。


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