对于非典型的植物基因,有什么研究方法吗??
有的,可以利用计算机模型进行功能预测后再研究。
随着近年来生物信息学分析的大力发展,已经可以通过一些计算模型来进行基因功能的研究。针对非典型的植物基因,现在也有一种被称为AraNet的计算机模型,开发者_开发问答可以帮助预测其基因功能。
这种模型利用的是一种“社交网络”的工作原理,能够通过连接的形式找到不同基因之间的相关性,认为在物理位置上处于同一个区域的基因,或是要与其他基因共同配合才能发挥作用的基因,可能具有相同的特征或类似的功能,其原理类似于facebook中可以通过你的朋友名单来推测出你的一些特征。
科学家利用这个工具在拟南芥上进行了实验,发现它可以包含拟南芥中19600多个基因中的一百万个连接,将这些连接依据相互关系做成一张完整的功能关系网络图后,就能够利用已知特征的基因去预测未特征化基因的功能。
这个模型主要利用两种假设的方法来检测,一是利用已知参与某个应激反应的一套基因作为“诱饵”来发现另一些也参与这个应急反应的新基因,之后通过几十种计算或是相关实验,证明这些基因是否真的相互关联,若这些关联比偶然机会发生的关联几率要大得多,即出现关联的频率要高得多,就可以认为假设成立;另一个就是预测未知基因的功能,主要是通过它们与已知基因的关系来推测,可以为后期功能验证找到一些候选基因。
为了验证这个模型的准确性,科学家选择了三个未知基因进行功能预测,通过后期的验证试验,发现有两种都表现出了该模型预测的表型,证明这种模型有一定的可靠性,至少比早前利用小规模网络预测的结果更可靠。
北海浪花三千丈 2021-06-28 03:51 开发者_如何学Go
有很多啊。这得看楼主是想针对研究什么了啊。要是楼主是想仅仅克隆一个基因的话很简单的啊。你只要从NCBI里面找出模式植物里面的基因。然后你再用你所研究的植物的RNA进行测序,获得unigene基因序列,通过扩增在进行比对,就能知道这个基因的大致功能的。
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