染色质免疫沉淀测序技术有没有新的进展呢??
有啊,北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊课题组与汤富酬课题组合作,发展了一种基于微流控芯片的微量细胞样品处理与核酸俘获方法,成功实现了针对1000个细胞的染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq),所谓的ChIP-Seq方法,就是现代测序技术通过有针对性地俘获和富集特定蛋白,获取与这些蛋白结合的DNA片段,将其进行纯化后用于开发者_如何学Python高通量测序,获取特定DNA-蛋白相互作用和结合位点的完整信息。这一技术的开发,大大减少了样品起始量的消耗,在反应效率得到提升的同时极大地降低损失的发生,节约反应时间,还减少了操作误差,实现了更高的可靠性和更好的平行性。 利用微流控技术,将实验操作中关键的染色质与抗体-磁珠复合物的共价结合步骤与非特异性吸附的洗涤等步骤集成在一个微型器件上,可以同时进行多个样品的操作。并且这项技术也得到了很好的利用,研究人员利用这一方法,研究了H3K4me3在小鼠胚胎干细胞、小鼠表皮干细胞以及小鼠胚胎发育至6.5天的外胚层细胞中的修饰模式,与已有的技术相比,这一工作展示了目前细胞总起始需求量最少的无需测序建库前进行核酸扩增的微量细胞ChIP-Seq实验结果。
相关结果发表在Cell Research上。
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